Trabajos prácticos

1 – Dinámica Molecular de agua-hielo

• Instructivo
• Guía para la elaboración del informe
• Archivos:
  • Estructura inicial para las corridas de simulación (ice-0.gro)
  • Trayectoria de la minimización de energía (0,1ps) (ice-1-em.trr)
  • Trayectoria del sistema a 100K (10ps) (ice-2-100K.xtc)
  • Trayectoria del sistema a 273K (50ps) (ice-3-273K.xtc)
  • Trayectoria del sistema a 320K (100ps) (ice-4-320K.xtc)
  • Trayectoria del sistema a 273K luego de la fusión (100ps) (ice-5-water-273K.xtc)

Video – Introducción a la Dinámica Molecular

Video – Dinámica Molecular (Práctico Hielo)

2 – Estructuras de proteínas en 3D

• Instructivo
• Archivos:
  • Estructura de una proteína que liga ácidos grasos a membrana (FABP por sus siglas en Inglés) con la que vamos a trabajar. pdbID: 2wut